Allgemeine Informationen

Veranstaltungsname	Übung: 50.01.010 Introduction to Next Generation Sequencing Course
Untertitel
Veranstaltungsnummer	50.01.010
Semester	SoSe2020
Aktuelle Anzahl der Teilnehmenden	9
erwartete Teilnehmendenanzahl	15
Heimat-Einrichtung	Graduate School Science, Medicine & Technology (Oltech)
Veranstaltungstyp	Übung in der Kategorie Lehre
Erster Termin	Montag, 21.09.2020 09:00 - 17:00, Ort: W01 0-008 (Rechnerraum)
Art/Form
Lehrsprache	englisch
ECTS-Punkte	2

Lehrende

Dr. Stefan Dennenmoser

Tutor/-in

Christine Steinseifer-Jeske, M.A.

Räume und Zeiten

W01 0-008 (Rechnerraum): Montag, 21.09.2020 - Mittwoch, 23.09.2020 09:00 - 17:00

Studienbereiche

Campusmanagementsystem Stud.IP
- Interdisziplinäre Lehreinrichtungen
  - PhD Programmes
    - Graduate School Science, Medicine and Technology
      - Interdisziplinäre Veranstaltungen / Interdisciplinary courses
    - Medicine and Health Sciences
      - Verbreiterung und Vertiefung von Fachwissen
        
        olt707 - Additional module „Specific knowledge”

Modulzuordnungen

Campusmanagementsystem Stud.IP
- Neurosensory Science and Systems - Strukturierte Promotion-Studiengang
  - Module
    - olt203 - Special techniques in Neurosensory Science and Systems
      - VA-Auswahl
- Molecular and Nanoscale Science - Strukturierte Promotion-Studiengang
  - Module
    - olt327 - Additional module "Specific knowledge"
      - VA-Auswahl
- Environmental Sciences and Biodiversity - Strukturierte Promotion-Studiengang
  - Module
    - olt403 - Special techniques "Environmental Sciences and Biodiversity"
      - VA-Auswahl

Kommentar/Beschreibung

Online workshop via BBB/Stud.IP Meetings

Course content:
Next Generation Sequencing technologies have recently revolutionised biological sciences. This workshop will provide students with an introduction to bioinformatic approaches to handle and analyse NGS datasets. The following topics will be treated:

Day 1: UNIX/Linux and Perl for Bioinformatics
Day 2: Introduction to NGS: Platforms, File formats, Quality control and preprocessing, alignments
Day 3: NGS toolkits, evaluation of alignments, mapping statistics, alignment visualisation
The course consists of lectures and accompanying practical exercises.

Technical requirenments:
For access to the Universities HPC Cluster, Windows user need MobaXterm and Linux/Mac user can log on via the ssh terminal. Additionally, you need R and a texteditor like notepad++ or emacs.

Anmelderegeln

Diese Veranstaltung gehört zum Anmeldeset "Anmeldung gesperrt (global)".

Erzeugt durch den Stud.IP-Support
Folgende Regeln gelten für die Anmeldung:

Die Anmeldung ist gesperrt.

Anmeldemodus

Die Auswahl der Teilnehmenden wird nach der Eintragung manuell vorgenommen.

Nutzer/-innen, die sich für diese Veranstaltung eintragen möchten, erhalten nähere Hinweise und können sich dann noch gegen eine Teilnahme entscheiden.

Die Anmeldung ist verbindlich, Teilnehmende können sich nicht selbst austragen.

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