mar463 - Aquatic Microbial Ecology (Complete module description)

Module label	Aquatic Microbial Ecology
Module code	mar463
Credit points	6.0 KP
Workload	180 h
Institute directory	Institute for Chemistry and Biology of the Marine Environment
Applicability of the module	Master's Programme Marine Environmental Sciences (Master) > Mastermodule
Responsible persons	Brinkhoff, Thorsten Henning (module responsibility) Garcia, Sarahi Lorena (Module counselling)
Prerequisites	Keine
Skills to be acquired in this module	Gewinnung der theoretischen Übersicht und von eigenen praktischen methodischen Erfahrungen bei aktuellen Fragestellungen, Ansätzen und Methoden der Aquatischen Mikrobiellen Ökologie: Analyse von wichtigen labilen gelösten Substraten von Bakteriengemeinschaften. Quantitative Analyse der Abundanz von Bakterien in Gewässern. Analyse der Zusammensetzung von Bakteriengemeinschaften mit PCR-basierten kultivierungsunabhängigen Methoden. Verfassen eines Protokolls von wissenschaftlichen Versuchen. Interpretation und Präsentation von wissenschaftlichen Daten.
Module contents	VL + Ü Untersuchungsmethoden in der aquatischen mikrobiellen Ökologie Vorlesung: Einführung und Überblick über grundlegende Aspekte, Fragestellungen und insbesondere Methoden der Aquatischen Mikrobiellen Ökologie, vor allem mit Relevanz für marine Bakteriengemeinschaften in der Wassersäule. Übung: Konzentrationsanalysen von gelösten Aminosäuren und Kohlenhydraten mittels Hochleistungsflüssigkeitschromatografie (HPLC), Bakterienzellzahlbestimmung mittels Durchflusszytometrie und Epifluoreszenzmikroskopie und bildanalytischer Auswertung, DNA-Extraktion, PCR-Amplifikation von 16S rRNA-Genfragmenten, bioinformatische Analyse von Sequenzdaten.
Recommended reading	Wird in den Veranstaltungen bekannt gegeben.
Links
Languages of instruction	German, English
Duration (semesters)	1 Semester
Module frequency	jährlich
Module capacity	12 ( Proportionale Aufteilung zwischen Master MUWI und Master Microbiology, Verfahren siehe StudIP )
Type of module	Wahlpflicht / Elective
Module level	MM (Mastermodul / Master module)
Teaching/Learning method	Wahlpflichtbereich Biologie, Ökologie Blockveranstaltung: VL Untersuchungsmethoden in der aquatischen mikrobiellen Ökologie Ü Untersuchungsmethoden in der aquatischen mikrobiellen Ökologie
Previous knowledge	Nützlich: Grundlagen der Mikrobiologie, Grundlagen der analytischen Chemie

Type of course	SWS	Frequency	Workload of compulsory attendance
Lecture	1	WiSe	14
Exercises	6	WiSe	84
Total module attendance time			98 h

Examination	Prüfungszeiten	Type of examination
Final exam of module	Abgabe des Portfolio acht Wochen nach Ende des Blockpraktikums	1 benotete Prüfungsleistung Portfolio oder Protokoll Aktive Teilnahme Aktive Teilnahme umfasst die regelmäßige Teilnahme am Praktikum und Begleitseminar und die Erstellung des Portfolios (Protokoll) während bzw. nach Ende des Praktikums.