Module label | Compulsory Optional Subject Neurophysics and Neurotechnology |
Modulkürzel | phy735 |
Credit points | 6.0 KP |
Workload | 180 h
( Präsenzzeit: 56 Stunden Selbststudium: 124 Stunden )
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Institute directory | Institute of Physics |
Verwendbarkeit des Moduls |
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Zuständige Personen |
Anemüller, Jörn (Prüfungsberechtigt)
Dietz, Mathias (Prüfungsberechtigt)
Hohmann, Volker (Prüfungsberechtigt)
Doclo, Simon (Prüfungsberechtigt)
Kollmeier, Birger (Prüfungsberechtigt)
Lücke, Jörg (Prüfungsberechtigt)
Schädler, Marc René (Prüfungsberechtigt)
Meyer, Bernd (Prüfungsberechtigt)
Uppenkamp, Stefan (Prüfungsberechtigt)
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Prerequisites | Bachelor Physik, Technik und Medizin oder entsprechend |
Skills to be acquired in this module | Nichtinvasive und invasive Forschungs-Methoden und – Gegenstände des Exzellenzclusters Hearing4all im biomedizinischen, neurophysiologischen und neuropsychologischen Bereich kennen und anwenden können |
Module contents | Biophysics of Sensory Reception General aspects of sensory reception and signal transduction: adequate stimulus, threshold sensitivity and signal-to-noise limitations, activation of receptor proteins. Evolutionary and ecological aspects of sensory reception. The senses: - Chemoreception in the gustatory cells and olfactory sensory neurons - Thermoreception in the skin - Infrared reception in the pit organ - Mechanoreception - auditory hair cells, somatosensory neurons in the skin, lateral line, proprioceptors, baroceptors - Photoreception - ciliary and rhabdomeric photoreceptor cells; - Electroreception in Lorenzini ampullae of elasmobranch fish and in tuberous receptors of mormyrid fish; derived electroreceptors in acquatic mammals - Magnetoreception - candidate structural correlates of magnetoreceptors Computational Neuroscience – Statistical learning Die Themen „Statistisches Lernen in den Neurowissenschaften“ und „Statistisches Lernen für die Auswertung neuronaler Populations-Daten“ werden in der Vorlesung eingeführt, durch passende Literatur im Seminar vertieft und in Übungsaufgaben am Computer praktisch umgesetzt. Informationsverarbeitung und Kommunikation: Grundfragen der Informationsverarbeitung (Klassifikation, Regression, Clustering), Lösungsmethoden basierend auf Dichteschätzung und diskriminativen Ansätzen (z.B. Bayes Schätzung, k-nearest neighbour, Hauptkomponentenanalyse, support-vector-machines, Hidden-Markov-Modelle), Grundlagen der Informationstheorie, Methoden der analogen und digitalen Nachrichtenübertragung, Prinzipien der Kanalcodierung und Kompression. Introduction in Data Analysis with Python - General concepts of programming languages - Python core-language features: Elementary data types, data structures, control structures, functions, classes and methods, modules and packages, file input/output, error handling. - Python expansions: SciPy libraries (Matplotlib, NumPy,...), pandas, scikit-image, VPython, ... |
Literaturempfehlungen | Biophysics of Sensory Reception: e.g., Kaupp (2010) Nat. Rev. Neurosc. 11:188-200; Palkar et al. (2015) Curr. Opinion Neurobiol. 34:14-19; Pan & Holt (2015) Curr. Opinion Neurobiol. 34:165-171; Lumpkin & Caterina (2007) Nature 445: 858-865; Lamb (2013) Progr. Retinal Eye Res. 36: 52e119; Progress in Retinal and Eye Research 20: 49-94; Baker et al. (2013) J. Exp. Biol. 216:2515-2522; Czech-Damal et al (2013) J. Comp. Physiol. 199:555-563; Hore & Mouritsen (2016) Ann. Rev. Biophys. 45: 299–344; Julius & Nathans (2012) Cold Spring Harbour Perspect Biol 2012;4:a005991; Introduction in Data Analysis with Python Mark Lutz, Learning Python: Powerful Object-Oriented Programming (2013, 5th Edition), O'Reilly Media Inc. 1590 pages Jess M. Kinder & Philip Nelson: A Student's Guide to Python for Physical Modeling (2015) Princeton University Press, 139 pages David Beazly & Brian K. Jones, Python Cookbook: Recipes for Mastering Python 3 (2013, 3rd Edition) O'Reilly Media Inc.687 pages. Wes McKinney, Python for Data Analysis: Data Wrangling with Pandas, NumPy, and IPython (2013, 1st Edition) O'Reilly Media Inc. 447 pages open access: http://www.swaroopch.com/notes/python/ and official language reference, http://docs.python.org/3/tutorial/index.html |
Links | |
Languages of instruction | German, English |
Duration (semesters) | 1 Semester |
Module frequency | Sommersemester |
Module capacity | unlimited |
Reference text | Lehrveranstaltungen: Es muss eine Auswahl der folgenden Veranstaltungen im Umfang von insgesamt 6 KP belegt werden: Bildgebende Verfahren in der Medizin (VL, 3 KP) Seminar Neurophysik (SE, 3 KP) Biophysics of Sensory Reception, VL/SE (6 KP) Computational Neuroscience – Statistical learning, VL/Ü/SE (6KP) Informationsverarbeitung und Kommunikation, VL/Ü (6 KP) Introduction in Data Analysis with Python, VL, Ü (6 KP) Angebot aus Studiengang Neurokognitive Psychologie (6 KP, nach individueller Vereinbarung) Angebot aus HNO- und Neurophysiologie/Neurochirurgie (6 KP) (Aus Medizin-Studiengang, nach individueller Vereinbarung) N.N. (Professur Modellierung und Physiologie auditorischer Wahrnehmung) |
Modullevel / module level | MM (Mastermodul / Master module) |
Modulart / typ of module | Wahlpflicht / Elective |
Lehr-/Lernform / Teaching/Learning method | Biophysics of Sensory Reception: Vorlesung: 2 SWS, Seminar: 2 SWS Computational Neuroscience – Statistical learning: Vorlesung/Übung/Seminar: 4 SWS Informationsverarbeitung und Kommunikation: Vorlesung: 2 SWS, Übungen: 2 SWS Introduction in Data Analysis with Python: Vorlesung: 2 SWS, Übung: 2 SWS |
Vorkenntnisse / Previous knowledge |
Form of instruction | Comment | SWS | Frequency | Workload of compulsory attendance |
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Lecture | 2 | WiSe | 28 | |
Seminar | SoSe oder WiSe | 0 | ||
Exercises | 2 | WiSe | 28 | |
Präsenzzeit Modul insgesamt | 56 h |
Examination | Prüfungszeiten | Type of examination |
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Final exam of module | M |