Stud.IP Uni Oldenburg
Universität Oldenburg
01.12.2021 11:07:49
mar454 - Einführung in die DNA-Sequenzierung und Sequenzanalyse (Vollständige Modulbeschreibung)
Originalfassung Englisch PDF Download
Modulbezeichnung Einführung in die DNA-Sequenzierung und Sequenzanalyse
Modulkürzel mar454
Kreditpunkte 6.0 KP
Workload 180 h
(
Präsenzzeit: 84 Stunden, Selbststudium: 96 Stunden
)
Einrichtungsverzeichnis Institut für Chemie und Biologie des Meeres (ICBM)
Verwendbarkeit des Moduls
  • Master Marine Umweltwissenschaften (Master) > Mastermodule
Zuständige Personen
Brinkhoff, Thorsten Henning (Modulverantwortung)
Moraru, Liliana Cristina (Modulberatung)
Teilnahmevoraussetzungen
Keine
Kompetenzziele

The students know how to

- sequence DNA by Sanger sequencing

- assemble DNA sequences

- use internet databases for sequence comparison

- use the various facilities of the NCBI database

- analyze bacterial genomes for presence of specific     

  Genes

- use Genious for genome analysis

- use ARB, databases and literature data

- create phylogenetic trees

- design primers and probes

- present and discuss scientific results

- write a scientific protocol  

 

Modulinhalte

Einführung in die Sequenzierung und Sequenzanalyse

The course starts with a lecture on the first two days. During the following days the participants will give seminar talks about different scientific studies for which DNA sequencing was highly relevant. DNA sequencing will be taught in the lab of the working group. Sequence analysis, introduction into the use of various internet databases, the sequence analysis program Genious and the phylogeny program ARB will be demonstrated by individual use of laptops of the institute.

 

Literaturempfehlungen
Will be announced
Links
Unterrichtsprachen Deutsch, Englisch
Dauer in Semestern 1 Semester
Angebotsrhythmus Modul
Aufnahmekapazität Modul 12 (
Verfahren siehe StudIP
)
Modullevel / module level MM (Mastermodul / Master module)
Modulart / typ of module Wahlpflicht / Elective
Lehr-/Lernform / Teaching/Learning method Sommersemester:

Blockveranstaltung
PR/SE Einführung in die Sequenzierung und Sequenzanalyse (4 SWS, 6 KP)
(Introduction into DNA-sequencing and sequence analysis)
Vorkenntnisse / Previous knowledge
Lehrveranstaltungsform Kommentar SWS Angebotsrhythmus Workload Präsenz
Seminar
2 SoSe 28
Praktikum
2 SoSe 28
Präsenzzeit Modul insgesamt 56 h
Prüfung Prüfungszeiten Prüfungsform
Gesamtmodul

Wird in den Veranstaltungen zu Beginn durch den Dozenten/die Dozentin bekannt gegeben.

1 benotete Prüfungsleistung

Portfolio (seminar presentation, written protocol)

Protocol (75 %), seminar presentation (25 %). Active participation (active and documented participation in practical courses (labs, exercises, seminars, field trips) and courses. These include e.g. the delivery of exercises, writing a lab report or seminar presentations according to the advice of the course supervisor.)