Das Projekt eignet sich als Bachelorarbeit oder als Forschungsmodul im Master.

Im Rahmen dieses Projekts wird ein tieferer Einblick in die Genetik einer marinen Kleinkrebs-Gruppe (Harpacticoida: Microarthridion) ermöglicht. Bei dieser Gattung gibt es Schwierigkeiten, zuverlässige COI-Sequenzen zu erhalten – ein wichtiges DNA-Barcoding-Marker-Gen. Ziel ist es daher, mitochondriale Genome mehrerer Arten zu sequenzieren. Auf dieser Basis sollen neue PCR-Primer entwickelt, Sequenzen in Metabarcoding-Datensätzen gesucht und DNA-Vergleiche mit weit entfernten Populationen (z. B. USA, Korea) durchgeführt werden. Das Projekt hat Potenzial für eine Veröffentlichung, da mitochondriale Genome in dieser Gruppe bisher kaum erforscht sind.

Die Arbeit wird durchgeführt am Senckenberg am Meer, Deutsches Zentrum für Marine Biodiversitätsforschung in Wilhelmshaven

Im Projekt werden mitochondriale Genome von Harpacticoiden der Gattung Microarthridion untersucht. Die Aufgaben umfassen die DNA-Extraktion und PCR von Einzeltieren, die Vorbereitung von Proben für Hochdurchsatz-Sequenzierung sowie die bioinformatische Auswertung der gewonnenen Sequenzen. Ziel ist es, neue Barcoding-Primer zu entwickeln und genetische Unterschiede zwischen geografisch weit entfernten Populationen zu vergleichen.

Die notwendigen Methoden werden im Laufe der Arbeit gelehrt, darunter fallen:

• Mikroskopie von mikroskopischen Tieren
• DNA-Extraktion und PCR für mitochondriale und nukleare Marker
•  Vorbereitung und Durchführung von Analysen für mitochondriale Genome
•  Datenaufbereitung von Sanger- und Hochdurchsatz-Sequenzierung
•  Grundlagen wissenschaftlicher Auswertung und Interpretation